Le programme comprend une majeure de 150 crédits, complétée

• soit par un approfondissement.  Les étudiants ont le choix entre deux approndissements  : « de la molécule à l’organisme » ou « de l’organisme à l’écosystème »
• soit par une mineure apportant une formation plus poussée vers la chimie (30 crédits) ;
• soit par une autre mineure choisie dans le programme de l'Université en concertation avec le conseiller aux études.

Le programme de la première année vise à l'acquisition de connaissances de base en sciences (mathématiques, physique, chimie, biologie, sciences de la Terre).  Au terme de cette première année, les étudiants peuvent se réorienter sans aucun complément vers la seconde année du baccalauréat en sciences chimiques et en bioingénieur et, moyennant l'ajout du cours de géographie (GEO 1111), en sciences géographiques.
 
La deuxième année est constituée d'un tronc commun de 50 crédits auquel s'ajoutent les 10 crédits de l’approndissement ou de la mineure. La troisième année, d’ un tronc commun de 40 crédits et les 20 crédrits d’approfondissement ou de mineure.

Le programme propose des regroupements de matières pour décloisonner les disciplines. L'approche interdisciplinaire est aussi suscitée dans les projets personnels ou en groupe. Plusieurs enseignements se basent sur l'auto-apprentissage. Une partie de l'évaluation est continue. La présentation de nombreux séminaires y contribue.
 
Des cours de langue accompagnent le programme et visent à la maîtrise de l'anglais scientifique.