Elle doit être choisie dès la première année et nécessite la participation à une sélection conformément aux règles établies par les responsables du programme CPME. Ce n'est qu'après avoir reçu l'accord de participation à ce programme que les étudiants devront prendre contact avec le vice-doyen pour aménager leur programme de cours personnel et répartir les cours CPME sur les deux années du master.
> Ecosystèmes et biodiversité (Option 14F)
> Forêts et société (Option 15F)
> Foresterie tropicale et développement (Option 16 F)
> Analyse et gestion de l'information en ingénierie biologique (Option 10F) (AGI)
> Création d'entreprise (Option 13F) (CPME)