Parallèlement à sa formation pratique, le candidat spécialiste suit un enseignement universitaire organisé de la façon suivante :
Première partie - Formation de base Deux années de formation comprenant :
Une année de chirurgie générale :
- Un enseignement théorique : Indications opératoires et techniques chirurgicales, y compris la pathologie générale, l'anesthésie loco-régionale et générale, la réanimation et la traumatologie
- Des séminaires
Un an de neurologie : les cours de la 1re année du programme de la première partie du diplôme d'études spécialisées en neurologie.
L'enseignement théorique de ces deux premières années s'inscrit dans la formation universitaire spécifique (FUS).
Deuxième partie - Formation supérieure
Quatre années de formation :
- Un enseignement théorique dont " Traitement informatique d'images médicales"
- Des séminaires : Séminaire (univ. et interuniv.) de neurochirurgie
- Une formation clinique encadrée : Cliniques de neurochirurgie
- en outre, un cours à option en neuroradiologie, neuropathologie ou neurophysiologie