Les programmes sont organisés au sein de dix facultés et trois entités hors facultés dont deux instituts
Sciences humaines (à Louvain-la-Neuve)
Sciences de la santé (à Bruxelles, sauf l'Institut d'éducation physique et de réadaptation, situé à Louvain-la-Neuve)
Sciences et technologies (à Louvain-la-Neuve)
Entités hors secteurs
