Les programmes sont organisés au sein de dix facultés et de deux instituts
Sciences humaines (à Louvain-la-Neuve)
Sciences médicales (à Bruxelles, sauf l'Institut d'éducation physique et de réadaptation, situé à Louvain-la-Neuve)
Sciences exactes et appliquées (à Louvain-la-Neuve)
