Titre :
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Assay optimization for molecular detection of Zika virus (2016)
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Titre original:
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Optimisation des tests pour la détection moléculaire du virus Zika
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Auteurs :
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CORMAN V. ;
RASCHE A. ;
BARONTI C.
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Type de document :
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Article : texte imprimé
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Dans :
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Bulletin of the World Health Organization (Vol. 94 n° 12, Décembre 2016)
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Article en page(s) :
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pp.880-892
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Note générale :
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biblio.
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Langues:
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Anglais
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Catégories :
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MALADIE INFECTIEUSE
VIRUS
EPIDEMIE
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Mots-clés:
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MALADIE INFECTIEUSE
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VIRUS
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EPIDEMIE
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ZIKA
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Résumé :
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ObjectifÉtudier la performance diagnostique des tests basés sur l'amplification en chaîne par polymérase (PCR) en temps réel après transcription inverse (RT) pour détecter le virus Zika.MéthodesNous avons comparé sept tests publiés utilisant la RT-PCR en temps réel et deux nouveaux tests développés par nos soins. Afin de déterminer la sensibilité analytique de chaque test, nous avons conçu un acide ribonucléique synthétique de contrôle universel (ARNcun) contenant toutes les régions ciblées par les tests sur une hélice ARN et enrichi de l’urine ou du sang humain de quantités connues de souches africaines ou asiatiques du virus Zika. Les charges virales dans 33 échantillons provenant de patients infectés par le virus Zika ont été déterminées à l'aide de l'un des nouveaux tests.RésultatsLes oligonucléotides des tests publiés utilisant la RT-PCR en temps réel ont présenté jusqu'à 10 mauvais appariements potentiels avec la lignée asiatique provoquant l'épidémie actuelle, alors qu'on a constaté de 0 à 4 mauvais appariements dans le cas des nouveaux tests. La limite de détection inférieure à 95% des sept tests les plus sensibles variait de 2,1 à 12,1 copies d'ARNcun/réaction. Deux tests présentaient des sensibilités plus basses de 17,0 et 1373,3 copies d'ARNcun/réaction et montraient une sensibilité similaire lorsque des échantillons enrichis étaient utilisés. Les charges virales moyennes dans les échantillons provenant de patients infectés par le virus Zika étaient de 5 × 104 copies d'ARN/mL de sang et de 2 × 104 copies d'ARN/mL d'urine.ConclusionNous proposons pour détecter le virus Zika des réactifs et des protocoles actualisés, adaptés aux souches responsables de la flambée actuelle. Tous les tests publiés ne permettent pas de détecter le virus Zika en raison d'une sensibilité limitée et d'une incompatibilité potentielle avec certaines souches. Les concentrations virales dans les échantillons cliniques étaient proches de la limite de détection technique, ce qui laisse penser que l'utilisation de tests insensibles donnera des résultats faussement négatifs.
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Note de contenu :
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INTERVENANT, SCIENTIFIQUE
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