AGRO Faculté d'ingénierie biologique, agronomique et environnementale

Le DEA en bioinformatique est un programme interuniversitaire de troisième cycle géré conjointement par l'Université libre de Bruxelles (ULB), l'Université de Liège (ULg), les Facultés universitaires Notre-Dame de la Paix de Namur (FUNDP), la Faculté d'ingénierie biologique, agronomique et environnementale de l'Université catholique de Louvain (UCL) et l'Université de Mons-Hainaut (UMH).

Ce programme consiste en une année de formation pluridisciplinaire qui touche aussi bien aux aspects biologiques, informatiques et statistiques qui constituent les fondements de la recherche en bioinformatique. Toutes les activités proposées dans ce programme combinent l'apprentissage d'une base théorique robuste avec une mise en pratique sur base d'exemples concrets et relevant directement de la recherche en bioinformatique. Des renseignements peuvent être obtenus sur le site
: http://www.ucmb.ulb.ac.be/bioinformatic/dea/

Admission académique:

Le DEA en bioinformatique est accessible aux porteurs des diplômes suivants: licenciés ou maîtres en sciences mathématiques, physiques, chimiques, biochimiques, biologiques, informatiques, en sciences biomédicales, ingénieurs civils chimistes, physiciens et informaticiens, ingénieurs agronomes, ingénieurs chimistes et des bioindustries, pharmaciens, docteurs en médecine, en médecine vétérinaire et en sciences vétérinaires. Une commission d'admission sera chargée d'établir l'admissibilité des candidats et leur programme de mise à niveau éventuel. Cette commission remettra son avis aux organes compétents de chacune des institutions partenaires.

Admission administrative:

Après avoir reçu l'avis de la commission d'admission, la candidat prend une inscription au rôle de l'institution de son choix.

Tous les renseignements concernant les modalités de l'admission administrative et académique à l'UCL peuvent être obtenus auprès du secrétaire académique de la Faculté d'ingénierie biologique, agronomique et environnementale: Professeur J. Decallonne, Croix du Sud, 2 Bte 12 , B-1348 Louvain-la-Neuve. Tél: (32 10) 47.36.72 E-mail: decallonne@mbla.ucl.ac.be

Le DEA s'étendra sur un an, comportant 175h de cours et un stage de formation en laboratoire, équivalent à 125h de cours. L'organisation des cours doit permettre à l'étudiant de réaliser le stage de formation dans une institution de son choix et de suivre un stage ininterrompu dans une période pouvant s'étendre du 1er janvier au 31 mai. Les candidats n'ayant pas de notions suffisantes en biologie moléculaire devront suivre une formation complémentaire d'environ 90 heures, sélectionnées parmi les cours de second cycle des institutions partenaires. Les cours sont donnés par blocs dans chacune des universités partenaires de manière à réduire les déplacements des étudiants, tout en leur offrant un contact avec chacune des institutions.

Les étudiants pourront également suivre un stage de spécialisation (3-4 mois) dans un laboratoire universitaire, d'un institut de recherche ou d'une entreprise, en Belgique ou à l'étranger. Ce stage est optionnel et mentionné comme une addition au diplôme.

Les cours visent à apporter une formation approfondie dans le domaine de la bioinformatique. Au-delà d'un bref rappel des bases de la spécialité considérée, il s'agit d'une formation scientifique de haut niveau. L'enseignement est organisé par modules comprenant un quota minimal de 175 heures en dehors des stages. Chaque module est sous la responsabilité d'un ou plusieurs titulaires. Chaque enseignement est donné sous-forme de séminaires. Il comporte une partie assurée par les titulaires et une autre, par des invités extérieurs spécialistes du domaine. Il est complété par des articles de revue et de recherche en relation directe avec le contenu du cours.

• Eléments de statistique: aspects théoriques et applications à la bioinformatique

Cours de 30h. presté à l'ULg, coordination: Jacques van Helden

• Bases de données biologiques:

cours de 30h. presté à l'ULB, coordination: Jean Richelle et Shoshana Wodak

• Analyse de séquences nucléotidiques et peptidiques:

Cours de 30h. presté aux FUNDP, coordination: Eric Depiereux et Bernard Joris

• Génomique et protéomique:

Cours de 30h. presté à l'UCL et à l'UMH, coordination: Shoshana Wodak, Xavier Debolle, Rudy Wattiez, Michel Georges et Marc Boutry

• Phylogeny inferrence:

Cours de 10h. presté à l'ULB, coordination: Michel Milinkovitch

• Elements de programmation:

Cours de 30h. presté à l'ULB, coordination: Marc Colet

• Modélisation des processus cellulaires:

Cours de 10h. presté à l'ULB, coordination: Denis Thieffry et Jacques van Helden

• Stage de formation:

Equivalent à 125h de cours, presté dans un des laboratoires participant à l'organisation du programme, coordination : Eric Depiereux (tél. : 081/72 44 15)

• Stage de spécialisation:

Prestation à temps plein pendant trois mois au sein d'un laboratoire d'une institution d'accueil pouvant être une université, un centre de recherche ou une entreprise, en Belgique ou à l'étranger. Coordination : Eric Depiereux (tél. : 081/72 44 15)

A la fin du premier semestre (deuxième quinzaine de décembre), l'étudiant est évalué sur les cours suivis et le travail de recherche personnel réalisé. La réussite des cours et du travail de recherche personnel constitue un prérequis pour l'admission au stage de spécialisation. Le stage de spécialisation fait l'objet d'un rapport écrit et d'une présentation publique qui se situe dans la deuxième quinzaine du mois de juin.

La délibération du DEA réunit le collège des enseignants sous la présidence d'un académique désigné par le comité de gestion du programme, qui proclame les résultats. Les cours et le stage de formation interviennent chacun pour 50% de la cotation globale. Le stage de spécialisation est évalué séparément sous réserve que l'étudiant ait satisfait à la première évaluation.

Le diplôme est décerné par l'institution où l'étudiant s'est inscrit et est signé par son Recteur. Il y est fait mention des institutions partenaires.

Après avoir obtenu le DEA, l'étudiant peut entreprendre une thèse de doctorat de type fondamental ou plus appliqué, ou se diriger vers un travail en entreprise.