Biochimie

Langue
d'enseignement

Français

Préalables

LSINC1131 et LSINC1132
Ce cours suppose acquises les notions de base de biologie et de chimie :
Pré-requis généraux nécessaires de Biologie:
Cours de Biologie générale tel que décrit dans l’UE « Biologie », en particulier les chapitres dédicacés aux molécules de la vie
Pré-requis généraux nécessaires de Chimie:
Les orbitales atomiques, les liaisons chimiques, la structure de l’eau et ses propriétés, le pH et osmolarité, les potentiels rédox, les groupements fonctionnels du vivant et les propriétés qu’ils confèrent à une molécule carbonée.
Réactions chimiques : principes de base (stoechiométrie, équilibre, énergie libre), les réactions de condensation/polymérisation, d’oxydo-réduction.

Le(s) prérequis de cette Unité d’enseignement (UE) sont précisés à la fin de cette fiche, en regard des programmes/formations qui proposent cette UE.

Thèmes abordés

Cette unité d’enseignement s’articule autour
1) des protéines de manière générale (relation structure-fonction, activité enzymatique, régulations, protéomique),
2) de notions de métabolisme

Acquis
d'apprentissage

A la fin de cette unité d’enseignement, l’étudiant est capable de :
.	percevoir la relation structure-fonction au niveau des protéines comprendre le rôle des enzymes dans la catalyse des réactions chimiques et comprendre la signification des paramètres enzymatiques classiques caractérisant une enzyme percevoir les différents niveaux de régulation permettant d’ajuster l’abondance et l’activité d’une enzyme dans un contexte cellulaire particulier comprendre ce que signifie homéostasie et les principes de base du métabolisme cellulaire percevoir les interconnections entre les différentes voies métaboliques abordées, et la signification de modifications d’abondance de métabolites

Contenu

Partie I : protéines 
Le cours de biochimie introduit les concepts de base de la biochimie au niveau de la structure des protéines en relation avec leur fonction, mettant en évidence les mécanismes mis en oeuvre pour expliquer les propriétés exceptionnelles des enzymes, à savoir un pouvoir catalytique extrêmement élevé et une très grande spécificité. Ces propriétés confèrent au vivant sa remarquable maîtrise de la matière et de l'énergie. Les bases de l'activité enzymatique et de la cinétique enzymatique abordées, ainsi que divers modes de régulation de l'activité enzymatique.
1. Introduction
2. Les acides aminés
3. Les peptides
4. Structure des protéines
5. Activité et cinétique enzymatique
6. Régulations de l'activité enzymatique
Partie II : métabolisme 
Les voies métaboliques liées au catabolisme du glucose sont étudiées : glycolyse, cycle de Krebs et oxydations phosphorylantes. L'accent est mis sur la régulation enzymatique dans un contexte métabolique.
1. Vue d'ensemble du métabolisme
2. Glycolyse
3. Cycle de Krebs
4. OXPHOS

Méthodes d'enseignement

Enseignement présentiel classique majoritairement : tableau + power point
Illustration des concepts lors des séances d’exercices

Modes d'évaluation
des acquis des étudiants

Examen oral

Faculté ou entité
en charge

EPL