Biochimie

Langue
d'enseignement

Français

Thèmes abordés

Cette unité d’enseignement s’articule autour
1) des protéines de manière générale (relation structure-fonction, activité enzymatique, régulations, protéomique),
2) de notions de métabolisme

Acquis
d'apprentissage

A la fin de cette unité d’enseignement, l’étudiant est capable de :
.	percevoir la relation structure-fonction au niveau des protéines comprendre le rôle des enzymes dans la catalyse des réactions chimiques et comprendre la signification des paramètres enzymatiques classiques caractérisant une enzyme percevoir les différents niveaux de régulation permettant d’ajuster l’abondance et l’activité d’une enzyme dans un contexte cellulaire particulier comprendre ce que signifie homéostasie et les principes de base du métabolisme cellulaire percevoir les interconnections entre les différentes voies métaboliques abordées, et la signification de modifications d’abondance de métabolites

Contenu

1. Protéines : relation structure-fonction

. Niveaux de structure – insister sur la notion de domaine protéique (y compris d’un point de vue évolution des génomes et protéomes)
. Folding (principes, données de cristallographiques vs modélisation) et dénaturation
. Activité enzymatique :
               . Les enzymes sont des catalyseurs
. Comment mesurer une activité enzymatique (et loi de Michaelis-Mentem)
               . Un exemple de mécanisme enzymatique détaillé (chymotrypsine)
. Paramètres cinétiques :

• Energie d’activation à kcat
• Affinité à Km

               . Classes d’enzymes (E.C. numbers)
. Régulations : allostérique, modifications post-traductionnelles, clivage, partenaire protéique, compartimentalisation
. Autres niveaux de régulation : l’abondance protéique dépend de l’expression génique, de la maturation et stabilité des transcrits, du taux de traduction et de dégradation protéique
Think out of the box : 1) moonlighting proteins 2) l’acétylation de la cyclooxygenase par l’aspirine (inhibiteur) modifie son activité

1. Métabolisme

. Bioénergétique et métabolisme :

• Cata vs anabolisme
• Key actors : ADP/ATP et NAD(P)+ /NAD(P)H
• Thermodynamique (Steady state, ∆G°, ∆G, Keq)

. Métabolisme du glucose (glycolyse, TCA, OXPHOS)

Méthodes d'enseignement

En raison de la crise du COVID-19, les informations de cette rubrique sont particulièrement susceptibles d’être modifiées.

Enseignement présentiel classique majoritairement : tableau + power point
Illustration des concepts lors des séances d’exercices

Modes d'évaluation
des acquis des étudiants

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Examen oral

Faculté ou entité
en charge

EPL