Analyse biochimique et notions de génie génétique: analyse biochimique

lbirc2101a  2019-2020  Louvain-la-Neuve

Analyse biochimique et notions de génie génétique: analyse biochimique
Note du 29 juin 2020
Sans connaitre encore le temps que dureront les mesures de distances sociales liées à la pandémie de Covid-19, et quels que soient les changements qui ont dû être opérés dans l’évaluation de la session de juin 2020 par rapport à ce que prévoit la présente fiche descriptive, de nouvelles modalités d’évaluation des unités d’enseignement peuvent encore être adoptées par l’enseignant ; des précisions sur ces modalités ont été -ou seront-communiquées par les enseignant·es aux étudiant·es dans les plus brefs délais.
4 crédits
18.5 h + 22.5 h
Q1
Enseignants
Chaumont François; Hachez Charles; Morsomme Pierre (coordinateur);
Langue
d'enseignement
Français
Préalables
Cours de biochimie et de génétique de BAC
Thèmes abordés
La première partie commencera par un bref rappel de la manière avec laquelle l'information génétique d'un organisme, procaryote ou eucaryote, est exprimée et régulée à différents niveaux: transcription, traduction, modifications post-traductionnelles. Ensuite la biologie moléculaire sera abordée sous un aspect plus technologique. On verra, dans les grandes lignes, comment les outils du génie génétique sont mis à profit pour isoler et caractériser des gènes, les modifier et les transférer entre espèces. La seconde partie exposera les principes à la base des méthodes les plus classiques qui sont utilisées, d'une part, pour purifier les macromolécules biologiques et, d'autre part, pour déterminer leur identité et leurs propriétés biochimiques. Des exercices pratiques seront organisés pour illustrer les techniques les plus utilisées en génie génétique, les techniques de purification et de caractérisation de protéines ainsi que les méthodes d'identification les plus courantes.
Contenu
Partie 1. Notions de génie génétique (4 ECTS) Régulation de la transcription et de la traduction, modifications post-traductionnelles, adressage de protéines dans les compartiments sub-cellulaires. Les outils du génie génétique (endonucléases de restriction, enzymes de modification). Vecteurs de clonage : plasmides, phages, chromosomes artificiels. Construction de banques génomiques et d'ADNc. Crible de banques d'ADN (notions). Caractérisation d'un gène : carte de restriction, séquence nucléotidique, profil d'expression. Techniques de clonage dérivées de la PCR (réaction d'amplification en chaîne). Notions d'expression hétérologue.
Partie 2. Analyse biochimique (4 ECTS) Centrifugation et fractionnement de cellules, d'organites ou de molécules. Techniques courantes de chromatographie. Electrophorèse de protéines (1D et 2D). Techniques de microscopie (lumière visible et fluorescence). Modifications de protéines: spectrométrie de masse et séquençage. Identification immunologique (ELISA, western blot, in situ). Séquençage d'ADN. Tests d'identification et de génotypage basés sur les sondes d'ADN et la PCR
Méthodes d'enseignement
Les professeurs expliquent la matière en auditoire. Des concepts théoriques sont mis en pratique au cours des travaux pratiques.
Modes d'évaluation
des acquis des étudiants
Une interrogation sur les travaux pratiques est réalisé lors de la dernière séance du quadrimestre. Cette évaluation se fait à livre ouvert et représente 25% de la note finale. Aucune autre évaluation n'est organisée pendant les sessions d'examen;  la note obtenue est réputée attachée à chacune des sessions de l’année académique.
L'examen de la partie théorique est à livre fermé. Il porte sur les connaissances des concepts théoriques vus au cours et sur la capacité de l'étudiant à utiliser ces concepts pour résoudre des questions plus concrètes. Il représente 75% de la note finale.
Autres infos
Chaque partie du cours à savoir Notions de génie génétique (partie 1) et analyse biochimique (partie 2) peut être suivie individuellement comme cours à option dans le cadre du Master BBMC.
La participation aux travaux pratiques est obligatoire. Toute absence injustifiée entrainera une pénalité sur la note finale du cours.
Ce cours peut être donné en anglais.
Ressources
en ligne
Moodle
Bibliographie
Syllabus et notes de cours
Faculté ou entité
en charge
AGRO


Programmes / formations proposant cette unité d'enseignement (UE)

Intitulé du programme
Sigle
Crédits
Prérequis
Acquis
d'apprentissage
Master [120] : ingénieur civil biomédical

Master [120] en biochimie et biologie moléculaire et cellulaire

Master [120] : bioingénieur en sciences agronomiques

Master [120] : ingénieur civil en chimie et science des matériaux

Master [60] en sciences biologiques