Traitement statistique des données -omiques

lstat2340  2018-2019  Louvain-la-Neuve

Traitement statistique des données -omiques
3 crédits
15.0 h
Q2
Enseignants
Bugli Céline (supplée Govaerts Bernadette); Govaerts Bernadette;
Langue
d'enseignement
Français
Préalables
Les cours LSTAT2020 Calcul statistique sur ordinateur, LSTAT2110 Analyse des données et LSTAT2120 Modèles linéaires doivent être acquis.
Thèmes abordés
  • La normalisation de données omics (que ce soit génomiques ou métabolomique)
  • Les méthodes mathématiques et statistiques pour le prétraitement de données spectrales (ex : modèles semi-paramétrique de lissage pour correction de ligne de base, alignement de pics')
  • L'organisation d'expériences pour analyser la qualité informatique de données omics et leur analyse par modèles à composantes de variance, méthodes de classification et méthodes multivariées telles
  • ASCA,ANOVA-PCA'
  • La modélisation de données de grande dimension dans un but de recherche de biomarqueurs ou de prédiction par modèle PLS, O-PLS, ICA, arbres de décision'
  • Les méthodes pour tests multiples (FDR')
  • Les méthodes d'intégration de données (analyse de données multitableaux')
  • Revue et utilisation des packages R les plus courants dans le domaine (ex : bioconductor)
  • Application sur des bases de données réelles.
Faculté ou entité
en charge
LSBA


Programmes / formations proposant cette unité d'enseignement (UE)

Intitulé du programme
Sigle
Crédits
Prérequis
Acquis
d'apprentissage
Master [120] en statistique, orientation biostatistiques

Master [120] en statistique, orientation générale

Master [120] en science des données, orientation statistique