Traitement statistique des données -omics

Les cours LSTAT2020 Calcul statistique sur ordinateur, LSTAT2110 Analyse des données et LSTAT2120 Modèles linéaires doivent être acquis.

• La normalisation de données omics (que ce soit génomiques ou métabolomique)
• Les méthodes mathématiques et statistiques pour le prétraitement de données spectrales (ex : modèles semi-paramétrique de lissage pour correction de ligne de base, alignement de pics')
• L'organisation d'expériences pour analyser la qualité informatique de données omics et leur analyse par modèles à composantes de variance, méthodes de classification et méthodes multivariées telles
• ASCA,ANOVA-PCA'
• La modélisation de données de grande dimension dans un but de recherche de biomarqueurs ou de prédiction par modèle PLS, O-PLS, ICA, arbres de décision'
• Les méthodes pour tests multiples (FDR')
• Les méthodes d'intégration de données (analyse de données multitableaux')
• Revue et utilisation des packages R les plus courants dans le domaine (ex : bioconductor)
• Application sur des bases de données réelles.