Epidémiologie génomique [ WESP2232 ]
3.0 crédits ECTS
15.0 h + 15.0 h
2q
Ce cours bisannuel est dispensé en 2010-2011, 2012-2013, ...
| Enseignant(s) |
Legrand Catherine ;
Devuyst Olivier ;
Vikkula Miikka ;
Persu Alexandre ;
Robert Annie (coordinateur) ;
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Langue
d'enseignement: |
Français
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| Lieu de l'activité |
Bruxelles Woluwe
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| Thèmes abordés |
Principaux thèmes à aborder :
Rappel des principes de base en génétique et étude des effets de gènes singuliers. Analyse de lien pour traits simples par des méthodes non paramétriques. Introduction à la génomique qui porte sur les fonctions et liens entre les gènes du génome. Analyse de lien pour traits complexes par des méthodes paramétriques. Étude d'associations génétiques.
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Acquis
d'apprentissage |
Former les étudiants aux approches épidémiologiques appliquées à la génomique humaine pour les initier aux méthodes qui permettent de déterminer si des variations génétiques humaines ont un impact direct ou indirect sur la santé ou la maladie.
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| Contenu |
Contenu
- Bases de la génétique des populations : Modèle d'équilibre d'Hardy-Weinberg et vérification statistique. Méiose, mitose et structuration des populations.
- Génétique quantitative: Décomposition de la variance phénotypique et variance expliquée par un locus. Héritabilité, apparenté et recherches de Quantitative Trait Locus. Analyse de ségrégation. Analyse de linkage.
- Classes d'études épidémiologiques : (1) Ségrégations, Etudes d'associations basées sur les familles, (2) Etudes de prévalence, d'associations gène- ou génotype- maladie, et interactions gène- gène et gène- environnement, (3) Valeurs diagnostiques de marqueurs génétiques, (4) Intérêt de marqueurs génétiques en prévention primaire.
- Génomique statistique : Cartes génétiques, LOD score, Cartes d'homozygotie, analyse d'association de traits multifactoriels (études cas seulement, cas- témoins, Disequilibrium Test TDT).
- Introduction à différents logiciels de statistique génétique (S.A.G.E. et JMP Genomics de SAS). Introduction à l'analyse de données micropuces.
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| Autres infos |
Cours pré-requis : Biostatistique. Epidémiologie. Statistique médicale avancée
Cours en relation . Logiciels de statistique et introduction à SAS
Évaluation : L'évaluation comporte une partie écrite que l'étudiant réalise avec l'ordinateur, à livre ouvert, et un examen oral.
Supports : Un syllabus est disponible dès le début de la formation. L'étudiant peut se procurer personnellement le logiciel S.A.G.E. mais pas JMP Genomics. Il aura accès à ce dernier dans la salle informatique d'EPID et celle de la faculté de médecine ou à l'Institut de statistique, pour autant qu'il soit inscrit au cours.
Khoury M, Little J, Burke W Ed (2004) HuGE: Human Genome Epidemiology. Oxford.
Elston R, Olson J, Palmer L Ed (2003) Biostatistical Genetics and Genetic Epidemiology. Wiley.
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Cycle et année
d'étude |
> Master [120] en statistiques, orientation biostatistique
> Master [120] en sciences de la santé publique
> Master [120] en sciences biomédicales
> Master [60] en sciences biomédicales
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Faculté ou entité
en charge |
> FSP
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