UCL - Systems Biology

[BRAI2219]

[30h] 3 crédits

Cette activité se déroule pendant le 1er quadrimestre.

Enseignants : Philippe Baret

Langue d'enseignement : Français

Niveau : Second cycle

Objectifs (en termes de compétences)
Résumé : Contenu et Méthodes
Autres informations (Pré-requis, Evaluation, Support, ...)

Objectifs (en termes de compétences)

La " systems biology " est une approche relativement récente visant à étudier de manière systématique les interactions complexes au sein des systèmes biologiques. Le but est de mettre en évidence des propriétés émergentes qui ne sont pas prises en compte par une approche réductioniste. La " systems biology " implique une approche interdisciplinaire, une vision holistique (qu'elle soit appliquée à l'échelle de la cellule, du tissu, de l'organe ou de l'organisme) et la maîtrise d'une analyse multi-échelle. En pratique, elle s'appuie sur la transcriptomique, la protéomique, la métabolomique, l'imagerie et toutes autres techniques permettant l'observation systématique de nombreuses variables, ou l'observation simultanée d'une ou plusieurs variables dans les différents compartiments du système. Une importance particulière est accordée à la dimension quantitative et à la modélisation. L'analyse porte tant sur la découverte et l'étude d'interactions complexes au sein du système, que sur la formulation d'hypothèses scientifiques en termes mathématiques et la réalisation d'expériences virtuelles (simulation) dont les résultats peuvent être confrontés aux observation.

L'objectif du cours est d'équiper l'étudiant pour réaliser ce changement de perspective du réductionisme au systémique et de le confronter à des situations où cette approche a été utilisée.

Résumé : Contenu et Méthodes

Définition et dimension épistémologique de la systems biology
Rappel des principes de systémique
Les niveaux d'articulation dans l'étude du vivant : de l'ADN à la population. Biologie intégrative.
Outils de la " systems biology " : transcriptomique, protéomique, métabolomique, réseaux d'interactions.
Etude de cas : régulation du cycle cellulaire, morphogenèse, analyse du génome humain, dynamique des populations

Autres informations (Pré-requis, Evaluation, Support, ...)

Concepts théoriques et mise en situation.