Génétique moléculaire et génomique microbiennes
[BBMC2106]
[36h + 18h] 5 crédits
Enseignants : Bernard Hallet, Bernard Hallet(supplée Jacques Mahillon), Pascal Hols, Pascal Hols(supplée Jacques Mahillon), Jacques Mahillon
Langue d'enseignement : Français
Niveau : Second cycle
Objectifs (en termes de compétences)
Objet de l'activité (principaux thèmes à aborder)
BBMC2106A : GénomiqueCe premier volet comporte tout d'abord une introduction portant sur les approches et les concepts généraux de la génomique descriptive et fonctionnelle. -émergence de la génomique.-méthodes de séquençage et d'annotation des génomes.-méthodes d'étude du transcriptome.-méthodes d'étude du protéome et de l'interactome.Cette introduction est suivie d'une présentation actualisée des apports de la génomique dans la compréhension du mode d'organisation des génomes microbiens (procaryotes et eucaryotes), des mécanismes d'évolution, et du mode fonctionnement de la cellule microbienne.Ces apports servent de support aux notions qui sont développées dans les deux autres modules de l'activité.
BBMC2106B : Régulation du génomeCe second volet a pour but d'approfondir les mécanismes utilisés par les cellules individuelles ou les populations de cellules microbiennes pour réguler l'expression de leurs gènes en fonction des conditions environnementales et leur état physiologique. -de la perception du signal à la réponse cellulaire-intégration des signaux et réseaux globaux de régulation génique (notions de régulon, de modulon, et de stimulon).-adaptation aux stress.-contrôle de processus de différenciation cellulaire microbiens (e.g. sporulation).-communication intercellulaire (quorum sensing) et réponses collectives (formation de biofilms, production de toxines, déclenchement de la virulence, comportement altruistes au sein de populations).-Mécanismes de variation de phase.BBMC2106C : Plasticité GénomiqueCe dernier volet aborde les stratégies évolutives du monde bactérien basées sur les réarrangements du génome et les transferts horizontaux d'information génétique. Ces stratégies sont confrontées à celles développées par les organismes sexués.-notions de flux, d'expansion et de régression génomique.-Notion d'éléments génétiques mobiles (plasmides, transposons, intégrons, phages).-Les mécanismes spécialisés de recombinaison génétique (constance et diversité).-Les mécanismes de transfert d'information génétique (conjugaison, transduction et transformation).-mutabilité et virulence.-émergence de nouveaux organismes pathogènes, affections nocosomiales et multi-resistance.-adaptation aux environnements extrêmes.
Résumé : Contenu et Méthodes
Vol.2 : Des intervenants extérieurs du monde académique ou industriel sont invités pour communiquer leur expérience scientifique et professionnelle en connexion avec les modules du cours. Des visites extra-muros sont organisées afin d'aller à la rencontre des professionnels du domaine sur le terrain.
Autres informations (Pré-requis, Evaluation, Support, ...)
L'étudiant doit être familiarisé aux concepts fondamentaux et techniques de base en microbiologie et biologie moléculaire
Evaluation
Les étudiants analysent un article récent en approfondissement des thèmes développés dans le cours et en présentent une synthèse devant la classe. L'intégration du sujet est évaluée lors d'une discussion après l'exposé.
Support
Documents et articles scientifiques proposés par les co-titulaires
Encadrement
Co-titulaires ayant des domaines d'expertise propres et complémentaires - invités extérieurs