Certaines bibliothèques de département ou d'unité sont conventionnées avec la BSE. Avec son appui, elles se sont donc engagées à respecter des règles d'ouverture aux utilisateurs et de catalogage des fonds disponibles. Les collections disponibles dans ces bibliothèques complètent les fonds de la BSE.

• Bibliothèque INGI (informatique) : Bât. Réaumur, Place Sainte-Barbe 2
• Bibliothèque MAPA-PHYS (mathématique et physique) : Bât. de Hemptinne, Chemin du Cyclotron 2
• Bibliothèque ARCH (Centre de Documentation de l'unité d'Architecture) : Bât. Vinci, Place du Levant 1
• La Bibliothèque CORE/STAT (operations research, econometrics, statistics) est également conventionnée avec la BSE et BSPO.